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“兰大·华羊芯”绵羊基因组育种芯片研发成功并产业化应用

科技日报记者 颉满斌

记者27日从兰州大学获悉,华羊该校反刍动物研究所王维民教授团队发布了国内首款基于大规模基因组选择参考群的芯绵芯片高性能绵羊基因组育种芯片“兰大·华羊芯”。这是羊基因组育种研发业化应用该团队组织实施的“绵羊双万羊基因组计划”的第一阶段成果。

为改变我国绵羊基因组育种技术落后的成功局面,王维民教授团队通过持续精准的并产大规模性能测定与基因组重测序,率先在国内构建规模达10318只、华羊羊只来源覆盖全国8家国家湖羊核心育种场和4家规模化湖羊种羊场的芯绵芯片基因组选择参考群,累计获得了80万条表型数据和78Tb基因组数据,羊基因组育种研发业化应用绘制出包含2000万个高质量遗传变异位点超高分辨率的成功湖羊基因组遗传变异图谱,鉴定出饲料转化率、并产生长速度、华羊尾脂重、芯绵芯片肌内脂肪等一系列重要经济性状关键基因。羊基因组育种研发业化应用

此后,成功研究团队联合石家庄博瑞迪生物技术有限公司,并产利用大数据、生物信息学、育种学等技术,研发出包含45052个具有代表性、全局性、功能性位点的高性能45K基因组育种芯片“兰大·华羊芯”,并衍生出适于不同应用场景灵活使用的10K低密度和1K超低密度两款配套使用的系列育种芯片。“芯片配套相应的遗传评估技术,可用于湖羊基因组选择育种、重要经济性状基因定位、品种鉴定、家系划分、系谱校正等。”王维民介绍。

据了解,“兰大·华羊芯”设计和遗传评估技术经业内专家反复论证,并在天津奥群牧业有限公司、甘肃润牧生物工程有限公司等有关企业进行了近万只羊的验证。结果显示,其在重要经济性状的选种准确性上已经可以比肩国际同行,我国绵羊育种中最具潜力的突破性性状饲料转化率的基因组预测填补了全球绵羊基因组选择育种的空白。

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